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多组学文献分享
多组学百问系列
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Q:测序饱和度高了有什么影响?低了有什么影响A:当测序饱和度高时,意味着每个细胞获得的测序数据量充足,可以更全面地覆盖细胞内的转录本,让我们更加准确地估计基因表达,同时也能更大程度地检测到那些表达量较...
Q:测序饱和度受到什么影响?A:测序饱和度受测序深度影响。一般来说,测序reads越多,被检测到的独特转录本就越多。如下图所示,被检测到的基因数会随着测序深度的增加而增加,但当测序深度达到一定程度,被...
Q:什么是测序饱和度?A:序饱和度(Sequencing Saturation)是反映当前测序量与文库复杂度相关性的指标。当测序饱和度达到一定水平时,意味着已经捕获到了细胞内大部分的RNA信息,细胞表...
Q:单细胞测序中的中位基因值是什么意思?A:单细胞测序中的中位基因值是指在一个细胞中表达的基因,表达水平处于中间水平的基因。通过计算每个细胞中检测到的基因数量,然后计算这些值的中位数,可以得到细胞的中...
Q:如何判定数据质量?A:拿到一个高质量的数据,第一步是需要获得高质量的单细胞悬液。单细胞悬液的细胞活性,要求大于 80%。目前常用的是 AO/PI 染色和台盼蓝染色法。...
Q:为什么高分文章中单个样本捕获细胞数在2000-3000?A:(1)不同的细胞浓度下,想要获得不同的目标细胞捕获数,需要上机不同体积的细胞悬液。在上机细胞悬液浓度固定时,如果目标细胞捕获数增加到80...
Q:细胞捕获数一般在多少呢?A:10X官方提到,单个样本建议的捕获细胞数范围是500-10000细胞,但从上表明显能看出一个规律:文章IF越高,总捕获细胞数越高,样本数越多,单个样本平均捕获的高质量细...
Q: marker gene一定特异性高表达吗?A: 单细胞转录组测序可以用于确定不同细胞类型的特异性基因表达情况,其中包括marker gene。然而,并不是所有的marker ...
Q:单细胞转录组测序,我们怎么确定使用什么marker 基因?A:确定使用哪些 marker 基因通常需要依赖于你研究的具体细胞类型和研究问题。在单细胞测序实验中,marker 基因通常是指与特定细胞...
Q:单细胞测序中的marker基因A:Marker基因的选择:在进行单细胞测序数据分析时,需要选择适当的marker基因来定义和区分不同的细胞类型。这些marker基因通常是与特定细胞类型相关的基因,...
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百沐生物孵化于复旦大学,核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成,专注于将人工智能(AI)技术与生物技术(BT)深度融合,为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台(BMBIOS)和小沐AI平台(AIGOBIO)。
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