iTRAQ/TMT标记定量蛋白质组研究是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行标记,利用标记试剂中的二级报告离子来对蛋白进行精确鉴定和定量。标记试剂分为两种:iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)和TMT(Tandem Mass Tags),是分别由美国AB Sciex公司和Thermo公司研发的多肽体外标记定量技术,采用多种同位素的标签,可与氨基(包括氨基酸N端及赖氨酸侧链氨基)反应实现连接,通过高精度质谱分析,同时实现多个样本蛋白组的定性和定量。
1.生物标志物发现:iTRAQ可以用于发现和验证疾病早期诊断和监测的生物标志物。通过比较病例组和对照组中的蛋白质表达差异,可以鉴定与疾病相关的蛋白质。
2.药物研发:iTRAQ可以用于评估药物治疗的效果和作用机制。通过比较药物处理组和对照组中的蛋白质表达变化,可以确定药物对特定病理过程的影响。
3.疾病机制研究:iTRAQ可以用于深入研究疾病的发病机制。通过比较不同病理状态下的蛋白质表达差异,可以识别与疾病发展相关的蛋白质。
4.蛋白质相互作用研究:iTRAQ可以用于鉴定和定量蛋白质之间的相互作用。通过分析不同蛋白质样品中的蛋白质组成,可以揭示蛋白质相互作用网络和信号通路。
5.植物蛋白质组学研究:iTRAQ可以用于研究植物蛋白质组的复杂性。通过比较不同植物组织或生长条件下的蛋白质表达差异,可以了解植物生长、逆境响应和代谢调控等方面的信息。
1.高通量:iTRAQ技术可以同时鉴定和定量多个蛋白质样品。通过使用不同的iTRAQ标记,可以将多个样品在同一实验中进行处理和分析,大大提高了实验的效率和吞吐量。
2.高灵敏度:iTRAQ技术可以检测低丰度的蛋白质。通过使用质量分析仪器进行谱图分析,可以对样品中的蛋白质进行高灵敏度的定量和鉴定,甚至可以检测到只有少量存在的蛋白质。
3.高精确性:iTRAQ技术具有较高的定量精确度。通过使用相同样品中的内部标准进行定量,可以减少实验中的技术变异,并提高结果的准确性和重复性。
4.全面性:iTRAQ技术可以同时鉴定和定量蛋白质样品中的大部分蛋白质。通过使用质谱分析仪器进行全面的蛋白质检测,可以获得全面的蛋白质表达谱,揭示样品中蛋白质的整体变化情况。
定量范围广:iTRAQ技术可以实现广泛的蛋白质定量范围。通过使用不同的iTRAQ标记,可以覆盖不同丰度范围的蛋白质,从低丰度到高丰度的蛋白质都可以进行定量分析。
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新型GBM蛋白标志物的鉴定与分析
Zhou H, Niu B, Wu X, Chu W, Zhou Y, Chen Z, Mi Y, Liu Y, Li P. iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of the effect of ACT001 on non-alcoholic steatohepatitis in mice. Sci Rep. 2023 Jul 13;13(1):11336. doi: 10.1038/s41598-023-38448-4. PMID: 37443174; PMCID: PMC10345009.
蛋氨酸和胆碱缺乏(MCD)饮食诱导C57BL/6J小鼠的NASH模型。采用全自动生化分析仪、酶联免疫吸附试验(ELISA)试剂盒、流式细胞仪、苏木精-伊红(H&E)、Masson和免疫组织化学染色检测血清和肝组织脂肪变性、炎症和纤维化相关指标。结果表明,ACT001降低了NASH小鼠的血脂和炎症因子水平,减轻了肝脏脂肪变性、炎症和纤维化,并抑制了肝脏氧化应激和NOD样受体蛋白3 (NLRP3)炎性囊泡的活化。此外,使用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术分析,在MCD组和ACT001高剂量组中鉴定出381个差异表达蛋白(DEPs),包括162个上调和219个下调蛋白。在这些DEPs中,选择5个与NAFLD相关的蛋白质进行实时荧光定量PCR (RT-qPCR)验证,结果与蛋白质组学一致。
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