单细胞ATAC

产品介绍：

单细胞ATAC-seq（Assay for Transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing）通过将单个细胞分离并利用DNA转座酶进行转座反应，然后对其进行测序，从而获得单个细胞的染色质开放区域的信息。这种方法可以解决细胞异质性问题，揭示不同细胞之间的染色质可及性差异和功能差异。

技术原理：

应用方向：

细胞类型鉴定：细胞的开放染色质区域、细胞的功能和特征、

发育过程研究：染色质可及性变化，揭示细胞的转录因子调控网络和细胞命运决定的机制。

细胞状态转换：研究细胞的分化过程、干细胞的自我更新和细胞的再编程过程等。

研究疾病和肿瘤异质性：疾病和肿瘤中细胞的染色质可及性变化、不同克隆细胞的异质性。

药物筛选和基因调控网络研究：研究药物对细胞染色质可及性的影响，从而发现新的治疗靶点和药物。

我们的优势：

1）更先进的平台选择-拥有高捕获效率的10X Genomics和国产单细胞捕获平台

2）更丰富的技术实力和经验-具有针对不同样本类型的单细胞悬液制备等样品处理方面的经验

3）更成熟的数据分析和解读能力-具备优秀的生物信息学团队，能够提供全面的数据分析服务和准确的结果解读

4）更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队，能够及时跟进前沿文献，提供个性化的实验设计和方案

5）更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道，并能高效高质量的交付结果

聚类分析

热图

注释细胞类型组织分布的点阵图

主要细胞类型组织分布的 UMAP 和条形图

RNA velocity 分析

热图

箱线图

拟时分析

差异表达基因的热图

Single-cell epigenomic landscape of peripheral immune cells reveals establishment of trained immunity in individuals convalescing from COVID-19. Nature Cell Biology，2021, ,IF=21.3

外周免疫细胞的单细胞表观基因组图谱揭示新冠肺炎康复者训练免疫的建立

该研究对COVID-19恢复期个体和健康个体的外周血单核细胞进行了单细胞染色质可及性和T细胞受体分析，发现COVID-19恢复期个体的T细胞和B细胞等免疫细胞均表现出染色质可及性的整体重构，这表明患者体内已建立免疫记忆

在COVID-19恢复期个体体内的b细胞加速发育

物种：人、小鼠以及其他物种要求有较高质量的基因组。

类型：新鲜组织、速冻组织、原代细胞、细胞系等。

来源：血液提取、磁珠富集、流式富集、组织解离等。

样本量及其它质控要求：

样本的保存与运输：

1) 细胞悬液：现场制备，或使用单细胞保护液，4℃运输，48小时内送达实验室。

2) 血液：EDTA抗凝的全血，4℃运输，24小时内送达，或室温2小时内送达实验室；或提取PBMC后冻存，干冰运输。

3) 组织：使用组织保存液（如：美天旎），4℃运输，48小时内送达实验室。