单细胞转录组测序

产品介绍：

单细胞转录组测序是一种用于研究单个细胞基因表达的高通量测序技术。可以对单个细胞的RNA进行测序，从而可以了解到细胞种群的异质性和细胞间的差异性。通过单细胞转录组测序，可以深入了解单个细胞的基因表达特征，揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能等。

应用方向：

发育生物学、免疫学、神经科学、癌症研究等领域，单个细胞的基因表达特征，揭示细胞异质性、发现新的亚型、研究细胞发育和分化过程、探索细胞类型和功能等

我们的优势：

1）更先进的平台选择-拥有高捕获效率的10X Genomics和国产单细胞捕获平台

2）更丰富的技术实力和经验-具有针对不同样本类型的单细胞悬液制备等样品处理方面的经验

3）更成熟的数据分析和解读能力-具备优秀的生物信息学团队，能够提供全面的数据分析服务和准确的结果解读

4）更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队，能够及时跟进前沿文献，提供个性化的实验设计和方案

5）更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道，并能高效高质量的交付结果

聚类分析

热图

注释细胞类型组织分布的点阵图

主要细胞类型组织分布的 UMAP 和条形图

RNA velocity 分析

热图

箱线图

拟时分析

差异表达基因的热图

Single-cell transcriptomic profiling reveals the tumor heterogeneity of small-cell lung cancer . Signal Transduction and Targeted Therapy,2022, IF=38.104

小细胞肺癌（SCLC）是肺癌中最具侵袭性和致命性的亚型。单细胞测序技术为我们提供了研究肿瘤微环境（TME）中个体细胞，并探究其在肿瘤生成过程中的作用的机会。本研究对来自11名SCLC患者的原发肿瘤（PTs）和匹配的正常邻近组织（NATs）中的约5000个单细胞进行了高精度的转录组分析，其中包括一名同时患有PT和复发肿瘤（RT）的患者。通过对比分析，该文章揭示了人类SCLC中的免疫抑制性特征。SCLC肿瘤中的恶性细胞呈现多样状态，主要与细胞周期、免疫和缺氧特性相关。单细胞数据还揭示了SCLC中关键转录因子（TF）的肿瘤内异质性（ITH），以及相关基因的表达模式和功能。在SCLC中，非神经内分泌（non-NE）肿瘤与增加的炎症基因标志物和免疫细胞浸润相关，这有助于更好地对免疫检查点抑制剂作出反应。这些发现表明了SCLC的显著异质性，以及癌细胞与TME之间在单细胞分辨率下的密切相互作用，从而为更好地理解SCLC的生物学特性以及开发新的SCLC治疗方法奠定了基础。

目前，单细胞转录组测序主要包括制备单细胞悬液，单细胞悬液质检合格后进行细胞捕获和文库构建。

单细胞悬液制备两种服务模式：

（1）组织保存液寄送：客户通过组织保存液寄送样品到百沐生物实验室，百沐生物实验工程师接收样本后进行单细胞悬液制备和质控、细胞捕获、文库构建和测序。

（2）预约上门服务（仅限 10x Genomics 平台）：百沐生物的实验工程师上门进行单细胞悬液制备和质控、10x Genomics 平台细胞捕获和 GEMs 逆转录，然后将逆转录产物寄回百沐生物实验室进行文库构建和测序。

不同类型样品处理和准备：

(1)新鲜组织样品

新鲜组织从活体取下后，去除周围的脂肪、结缔组织或者坏死组织，用 4℃预冷的 PBS或者生理盐水冲洗干净，放在PBS或者组织保存液中冰上直接转移到解离实验室；一般要求组织量为黄豆大小（约 200mg）；每个样品准备两个备份；组织太小，建议和实验室提前沟通，确定是否满足实验要求。新鲜组织也可通过组织保存液寄送到百沐生物实验室，具体操作参考实体组织组织保存液寄送要求。

(2)血液样品

取 5-10mL 新鲜血液迅速置于 EDTA 抗凝管中，4℃暂时保存和转移到实验室，也可以4℃寄送到实验室，寄送时间不超过 48h；小鼠等血液较少的可以准备1-2mL。

(3)体液

取 8-10mL 腹水、关节液和脑脊液等体液；冰上暂时保存和转移到实验室，立即进行单细胞悬液制备。

(4)冲洗液

肺泡灌洗液和膀胱冲洗液一般取 10-20mL 冰上暂时保存和转移到实验室，立即进行单细胞悬液制备。

(5)穿刺样品

穿刺样品量较少，需要多个穿刺样品（一般为 5 个）混合制备单细胞悬液，以保证足够的细胞量。

(6)细胞系

客户将培养的细胞收集后转交给百沐实验工程师；要求细胞总量为 50 万-100 万个/ 样品。

(7)单细胞悬液

分选后的细胞或客户制备好的单细胞悬液直接交给实验工程师，工程师进行细胞质检， 要求细胞总量一般至少为 10 万个

表 1 不同样品类型处理和准确总结：

实体组织组织保存液寄送：

目前，人和小鼠的多种肿瘤组织和正常组织都可以通过组织保存液寄送，我们推荐使用美天旎组织保存液（货号：130-100-008），组织一般可以保存 48h，甚至 72h；客户可以自备组织保存液或者免费申请公司寄送。

（1）客户申请组织保存液：

合同确定后，客户至少提前 3 天通过销售申请组织保存液，申请时提供合同号，样本量、收件地址、联系人和电话；百沐生物实验室收到申请信息后将所需数量的保存液免费邮寄给客户（一般 17:00 前申请，当天邮寄；17:00 后申请第二天邮寄）；邮寄的组织保存液一般为 2mL 离心管（内含 1.5mL 组织保存液），保存液的数量为 2 管/样品；通过冰袋邮寄给 客户。

（2）客户接收组织保存液：

客户收到组织保存液后，检查数量无误后可以立即使用或在4℃条件下保存。

（3）客户通过组织保存液寄送样品：

新鲜组织从活体取下后，去除周围的脂肪、结缔组织或者坏死组织，用预冷的 PBS 或者生理盐水冲洗干净；将组织分为黄豆大小（约 200mg）后放入组织保存液中，并轻轻颠倒离心管，使组织完全浸没到保存液中，补充一定量的保存液使其充满整个离心管；如果组织大于黄豆大小，建议分割成黄豆大小后放入不同的离心管中，组织太多，影响组织的保存效果。在离心管管盖和管壁同时标注样品名称，且管壁标注组织类型、浸入保存液时间；然后用封口膜封好，防止运输过程中离心管开盖；一般一个样品准备两个备份；将封好的离心管装入自封袋中，标注合同编号和客户姓名；将自封袋用棉花或者纱布包裹，避免离心管和冰袋直接接触，防止样品冷冻。用冰袋寄送样品（夏天放 10-15 个冰袋；冬天禁止使用-80℃立即拿出的冰袋，防止样品冻结），保证 48h 内到达百沐生物实验室，个别样品可以保存 72h。