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2023-11-20
来源：上海百沐生物科技有限公司
所属分类：单细胞测序100问
当测序饱和度高时，意味着每个细胞获得的测序数据量充足，可以更全面地覆盖细胞内的转录本，让我们更加准确地估计基因表达，同时也能更大程度地检测到那些表达量较低的转录本，提高数据的可信度和准确性。但是从单细胞实践角度来看，如果测序饱和度过高，则可能一次实验的细胞通量会较低，因为大量测序资源被用于重复测序，而非用于覆盖更多的细胞。测序饱和度高将增加测序成本，降低实验的效率。
如果测序饱和度过低，会降低数据的灵敏度和准确性，难以检测一些表达量较低的转录本，可能导致遗漏低表达基因或细胞亚群，影响数据解读和分析的可靠性。但这也取决于下游任务，如果只需要完成聚类和细胞类型注释，检测对象主要是细胞中高表达的标志基因，那么就不需要检测那些表达量较低的独特转录本，较低的测序饱和度也能够满足任务需求。
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