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全转录组测序

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产品介绍:

全转录组测序服务主要针对circRNA、lncRNA和mRNA,一举三得,一次测序可以同时得到三者分子的表达情况,可应用于新circRNA和lncRNA预测以及已知circRNA和lncRNA表达水平研究等。


技术原理:

分析流程:

应用方向:

1)基因表达调控研究: 全转录组测序可以揭示不同细胞类型、生理状态或疾病状态下各类转录本的表达变化,从而深入了解基因表达调控的机制。

2)异构体和可变剪切研究: 通过全转录组测序,可以识别和分析不同异构体和可变剪切事件,了解基因在转录水平上的多样性。

3)非编码RNA研究: 全转录组测序有助于发现和研究各类非编码RNA,如长链非编码RNA(lncRNA)和微小RNA(miRNA),以及它们在基因调控中的作用。

4)细胞信号传导研究: 通过分析全转录组数据,可以了解不同信号通路在转录水平上的活性和互动。

5)基因功能鉴定和新基因发现: 全转录组测序有助于识别编码蛋白质的基因以及潜在的新基因,帮助研究基因功能和多样性。

6)发育生物学研究: 全转录组测序可以用于比较不同发育阶段的转录组数据,了解基因表达在生物体发育过程中的变化。

7)疾病机制研究: 通过全转录组测序可以揭示疾病状态下各类转录本的表达变化,有助于找到与疾病相关的生物学过程和潜在的治疗靶点。

8)药物治疗研究: 全转录组测序可以评估药物对各类转录本的影响,从而揭示药物的作用机制、疗效和不良反应。

9)微生物组学研究: 对微生物的全转录组测序可以用于了解微生物在特定环境中的功能和适应策略。


我们的优势:

1)定量更准确

2)可重复性更高

3)检测范围更广

4)分析更可靠



差异基因及差异lncRNA的热图、火山图




ceRNA调节网络



差异表达的mRNA、lncRNA和circRNA的功能富集分析



单个可变剪切事件sashimi plot




可变剪切事件数目统计展示



Remodeling of maternal mRNA through poly(A) tail orchestrates human oocyte-to-embryo transition(Nat Struct Mol Biol,2023,IF=18.361)


研究人员利用PacBio全长转录组技术,深入研究了卵母细胞成熟和受精过程中的转录调控。他们发现,聚腺苷酸(poly(A))尾在母源mRNA的降解和合成过程中起着关键作用。此外,这些调控作用对人类卵母细胞至胚胎转化过程至关重要。这项研究对于了解生殖发育的分子机制和提高辅助生殖技术的成功率具有重要意义。



利用 PAIso-seq2 分析人类卵母细胞和早期胚胎



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