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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(87)-分析篇

2023-11-20

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:单细胞测序中的中位基因值是什么意思?

A:

单细胞测序中的中位基因值是指在一个细胞中表达的基因,表达水平处于中间水平的基因。通过计算每个细胞中检测到的基因数量,然后计算这些值的中位数,可以得到细胞的中位基因值。


中位基因值可以用来衡量单细胞测序样本中细胞的活性和表达水平。通常情况下,细胞的中位基因值越高,意味着该细胞在基因表达水平上越活跃。相反,中位基因值较低的细胞可能处于不活跃状态或者是死细胞。在单细胞测序数据分析中,中位基因值可以作为细胞质量控制的一个指标。通过对细胞进行中位基因值的筛选和过滤,可以排除掉一些表达异常或质量较差的细胞,从而提高数据的质量和可靠性。检测到的基因中位数范围一般要求≥700 有利于细胞分群,若数值 <500,得到的测序数据并不可靠。而且每个细胞的中位基因数和样本的细胞类型有关联,例如成熟的B 细胞、T 细胞含有的中位基因数较少,而肿瘤组织、干细胞等样本基因表达数量较多,含有的中位基因数也较高。


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