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靶向蛋白质组学(PRM)

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产品介绍

4D-PRM(Four-Dimensional Protein-RNA Interaction Map)技术是一种用于研究蛋白质与RNA相互作用的高通量测序技术。它通过结合近期发展的PRM技术和时间分辨的实验设计,可以在不同时间点上对蛋白质与RNA的相互作用进行全面的分析。


技术原理:

1.蛋白质和RNA交联:首先,利用交联剂将蛋白质与RNA交联,固定它们之间的相互作用。

2.核糖核酸酶消化:通过核糖核酸酶消化去除未交联的RNA,只保留与蛋白质交联的RNA。

3.RNA测序:对交联后的RNA进行高通量测序,获取蛋白质与RNA相互作用的信息。

4.时间分辨实验设计:通过在不同时间点上进行交联和测序,可以获取蛋白质与RNA相互作用在时间维度上的变化模式。

5.数据分析:对测序数据进行分析,包括蛋白质-RNA相互作用位点的鉴定、交互网络的构建和时间序列分析等,揭示蛋白质与RNA相互作用的动态性和功能调控机制。


应用方向:

1.转录调控研究:通过分析蛋白质与RNA的相互作用,揭示转录因子和调控RNA之间的相互作用网络,深入理解转录调控机制。

2.疾病机制研究:研究蛋白质与RNA的异常相互作用,探索与疾病发生和发展相关的分子机制。

3.药物研发:通过分析药物与RNA的相互作用,评估药物对靶向RNA的效果和安全性,优化药物设计和疗效。


我们的优势:

全面性:能够在全基因组范围内研究蛋白质与RNA的相互作用,揭示它们的潜在关联和功能。

高通量:通过高通量测序技术,可以同时分析大量蛋白质与RNA相互作用的信息。

时间分辨:通过时间分辨实验设计,可以观察蛋白质与RNA相互作用的动态变化,揭示其在不同时间点上的功能和调控模式。

灵活性:更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队,能够及时跟进前沿文献,提供个性化的实验设计和方案

性价比高:更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道,并能高效高质量的交付结果



差异蛋白验证的全覆盖




离子淌度分离


Wei X, He Y, Wan H, Yin J, Lin B, Ding Z, Yang J, Zhou H. Integrated transcriptomics, proteomics and metabolomics to identify biomarkers of astragaloside IV against cerebral ischemic injury in rats. Food Funct. 2023 Apr 24;14(8):3588-3599. doi: 10.1039/d2fo03030f. PMID: 36946308.


草药黄芪是一种药食两用草药。黄芪的主要成分黄芪甲苷(AS-IV)在缺血性脑损伤中具有神经保护作用,但其机制尚不清楚。我们的研究使用短暂大脑中动脉闭塞(MCAO)大鼠模型对受缺血影响的一侧大脑进行纵向多组学分析。基于转录组学和蛋白质组学分析,我们发现396个差异表达靶上调,114个差异表达靶下调。基于代谢组学共鉴定出117种差异代谢物。最后,我们使用Cytoscape 3.7.1的Metscape插件找到了8个对应于化合物-反应-酶-基因网络的中枢基因。



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