微生物多样性测序（16S/18S/ITS）

产品介绍：

微生物多样性测序是一种高通量DNA测序技术，广泛用于分析环境样本中微生物群落的组成和多样性。其中，16S/18S/ITS扩增子测序是一种常用的方法，利用特定的核糖体RNA基因片段（16S rRNA、18S rRNA和内转录间隔区，即ITS）作为标记，进行微生物群落结构的分析。

技术原理：

利用聚合酶链式反应（PCR）技术，选择性地扩增特定的目标DNA片段，通常是细菌和古细菌的16S rRNA基因区域，或者真核生物的18S rRNA/ ITS区域。这些片段具有高度保守的序列区域，同时包含足够的变异区域，可以用于区分不同的微生物。

16S rDNA基因测序区域

18S rDNA基因测序区域

ITS测序区域

分析流程：

应用方向：

1）环境微生物生态学：微生物多样性测序可用于研究不同环境中微生物群落的组成、结构和变化，如土壤、水体、海洋、空气等。

2）医学微生物学：在人体、动物和植物的微生物群落中，微生物多样性测序可用于分析不同部位的微生物组成，以及与宿主健康和疾病之间的关系。它在疾病诊断、药物研发和预防措施中有着重要应用。

3）食品和饮食微生物学：微生物多样性测序可以揭示食品样本中的微生物群落，从而帮助监测食品质量、安全性和新型食品生产方法的发展。

4）生物工艺和发酵：在生物制药、酿造和发酵等领域，微生物多样性测序可以帮助优化微生物菌株的选择、改良和监控，以提高生产效率和产物质量。

5）生态学和保护：通过分析野生动植物、珍稀物种和生态系统中的微生物群落，可以了解微生物与宿主之间的相互作用，从而为物种保护和生态系统管理提供支持。

6）环境监测和生态修复：微生物多样性测序在环境污染监测、生态修复和污水处理等领域可以帮助识别有益微生物群落，以及监测生态系统恢复的进程。

7）系统发育和分类学：利用微生物多样性测序数据，可以进行微生物物种的分类、系统发育和进化关系分析，有助于解析不同物种之间的遗传关系。

8）生态毒理学：通过分析微生物群落对环境毒性的响应，可以评估环境污染对生态系统健康的影响，从而为环境保护提供信息。

我们的优势：

1）价格优惠、交付周期短：提供综合比价通道，高效高质量的交付结果

2）疑难样本处理可处理：抽提效率高，最大化利用珍贵样本

3）严格的数据质控：严格的质量控制体系，保证准确性

4）测序平台：通量更高，速度更快，运行时间更短。

5）定制化分析方案：定制实验方法，个性化分析解决方案

基因组质量得分

PCA分析

系统发育进化树

系统发育进化树

箱线图

物种丰度和聚类图

物种相对丰度比较

菌株相对丰度

线性判别分析 

气泡散点图

热图

箱线图

网络互作及物种相关性

冗余分析

气泡图

KEGG通路富集差异表达基因 

差异基因富集

New insights from uncultivated genomes of the global human gut microbiome. Nature, 2019, IF=64.8

全球人类肠道微生物组未培养基因组的新见解

研究者从来自不同地理和表型的人类的3810个粪便基因组中重建60664个原核生物基因组，为2058个新确定的物种级操作分类单元(OTUs）提供参考点。平均而言，新发现的OTUS包括33%的个体丰富度和28%的物种多度，并在农村人口中富集。对临床肠道微生物组研究的荟萃分析指出，新发现的OTU与许多疾病有关，这些OTU有可能改进预测模型。最后，我们的分析表明，未培养的肠道物种经历了基因组缩减，导致某些生物合成途径的丧失，这可能为今后改进培养策略提供了线索。

新鉴定的肠道物种广泛分布在不同的分类群中

肠道OTUs与人类疾病的宏基因组关联

未培养的 OTUs基因组减少，缺少常见的生物功能