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2023-11-20
来源：上海百沐生物科技有限公司
所属分类：单细胞测序100问
序饱和度（Sequencing Saturation）是反映当前测序量与文库复杂度相关性的指标。当测序饱和度达到一定水平时，意味着已经捕获到了细胞内大部分的RNA信息，细胞表达的转录本和基因已经被有效地检测到。这表明测序数据的质量足够好，可以支持后续的细胞类型鉴定、表达谱分析等生物信息学分析。测序饱和度的倒数可以解释为检测一个新转录所需的额外reads。其计算公式为：
n_dedupedReads=准确比对的reads中唯一（有效barcode+有效UMI+基因）组合的数量。
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