DIA 定量蛋白质组学

产品介绍：

蛋白质组学届巨擘 Ruedi Aebersold 教授开创了基于质谱的生物样本数字化的 Data independent acquisition (DIA， 又称 SWATH)技术，帮助蛋白质组学迈向下一时代。通过他创立的 Biognosys 提供的整体解决方案，您可以轻松地实行大 规模样本的组学定量流程。取决于您的研究方向，可以选择发现式研究方案，剖析不同条件及处理下样品的成千上万种蛋白； 亦或是靶向研究方案，对选定的蛋白质进行高通量定量。 DIA 技术融合了传统蛋白质组学“鸟枪法”（shotgun）和质谱绝对定量“金标准”选择反应监测/多反应监测（SRM/MRM） 技术的优势和特点。另外，DIA 技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选 择、碎裂、检测，从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。DIA 技术具有全景式扫描、数据可回溯等优势。

技术原理：

我们的优势：

灵敏度高，无歧视地获得所有肽段的信息，不会造成低丰度蛋白信息的丢失。

循环时间固定，扫描点数均匀，定量准确度高。

重复性好，重复样品间的定量相关性可达到0.99以上。

更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队，能够及时跟进前沿文献，提供个性化的实验设计和方案。

更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道，并能高效高质量的交付结果。

Volcano Figure

HCA Figure

GO Classification Barplot 示例

GO Enrichment Barplot 示例

STRING 网络图示

Rouwette T, Sondermann J, Avenali L, Gomez-Varela D, Schmidt M. Standardized Profiling of The Membrane-Enriched Proteome of Mouse Dorsal Root Ganglia (DRG) Provides Novel Insights Into Chronic Pain. Mol Cell Proteomics. 2016 Jun;15(6):2152-68. doi: 10.1074/mcp.M116.058966. Epub 2016 Apr 21. PMID: 27103637; PMCID: PMC5083083.

新兴的数据独立采集(DIA)-质谱(MS)有可能提供无偏见的、可重复的和定量的蛋白质组图-这是实验标准化的先决条件。在这里，我们设计了一个基于DIA的蛋白质组学工作流程，以描绘慢性疼痛、炎症和神经病理性疼痛的两种小鼠模型中背根神经节(DRG)蛋白质丰度的变化。

样品准备：

样本的前处理包括蛋白的提取，变性，还原烷基化，酶解以及肽段的除盐等过程， 本项目用 iST 样本前处理试剂盒 （PreOmics, Germany）对组织样本进行前处理。 液氮研磨，取适量的样本，加入 50ul 的裂解液， 在 95°C 下，1000 rpm 加热 10 min. 样品冷却至室温， 加入胰蛋白酶消化缓冲液，37℃，500 rpm 振荡孵育 2 h。 加入终止缓冲液终止酶解反应。 采用试剂盒中的 iST cartridge 进行肽段的除盐， 2 × 100µl 洗脱缓冲液进行洗脱， 洗脱后的肽段真空抽干后-80 保存。