单细胞微生物基因组测序通过将单个微生物细胞分离并进行基因组DNA扩增,然后对其进行高通量测序,从而获得单个细胞的基因组序列。这种方法可以解决微生物群体中存在的细胞异质性问题,揭示不同细胞之间的遗传变异和功能差异。此外,单细胞测序还可以用于研究微生物在复杂环境中的生态功能和亚群体分化。
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聚类分析
热图
注释细胞类型组织分布的点阵图
主要细胞类型组织分布的 UMAP 和条形图
RNA velocity 分析
热图
箱线图
拟时分析
差异表达基因的热图
High-throughput, single-microbe genomics with strain resolution, applied to a human gut microbiome,Science. 2022
作者从来自人类肠道的复杂微生物群落中分离出单个微生物的基因组:用微流控技术将单个微生物包裹在液滴中裂解细胞释放DNA,用液滴中含有的特异性barcode进行标记扩增、测序,共得到了20,000多个微生物单扩增基因组,组装成了近100个细菌物种的基因组,其中包括几种具有多个亚种菌株的细菌,利用这些基因组来探索微生物之间的相互作用,重建了水平基因转移(HGT)网络并发现了92个物种对之间的HGT,并发现了噬菌体与一株普通拟杆菌的体内宿主-噬菌体关联关系。
Microbe-seq 工作流程以及已知在细菌菌株群落中的应用
肠道微生物组中 76 个细菌物种基因组
新鲜组织取下后放到25%甘油的PBS溶液中,-80度冻存,具体项目送样请咨询本公司。
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百沐生物孵化于复旦大学,核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成,专注于将人工智能(AI)技术与生物技术(BT)深度融合,为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台(BMBIOS)和小沐AI平台(AIGOBIO)。
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