空间代谢组学主要是针对组织、器官和细胞中代谢物的空间分布和变化的研究。这些研究有助于可视化和精确定位这些生物分子的位置,为理解目标生物过程(如疾病进展机制)提供了一个额外的维度。从空间代谢组学实验中获得的信息与某些组织区域或亚结构、器官和细胞中存在的生物分子的功能紧密相关。空间代谢组学已逐渐成为一门热门的技术。
空间代谢组学利用基质辅助激光解吸电离(Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization,MALDI)质谱成像的基本原理是将基质喷涂于样本上,使基质与代谢物形成共结晶,在激光照射下,基质分子获得激光能量并传递给代谢物使其离子化,电离后的离子进入质谱分析器检测。
医学方向
①通过空间代谢组学可以探讨生命科学中生物的物质组织的空间分布特征,进一步深入拓展研究机制,如在疾病(帕金森病、脑缺血、脑缺血、糖尿病、心血管疾病诊断、分型、治疗和预后的深入应用。
②从空间代谢物探讨肿瘤代谢癌症的发展的方式,寻找肿瘤诊断和生物标志物
③利用空间代谢组学判断药物的吸收、体内分布和药效评价机制等
④从空间代谢物的分布判断环境污染物在体内的毒性和分子机制等
⑤通过空间代谢物组学深入挖掘胚胎、器官发育过程中代谢调控和代谢先关的表型等
农学方向
①利用空间代谢组学深入逆境胁迫的防御性代谢物的空间分布变化
②从空间代谢组学的角度深入研究植物抗病毒的生成机制
③通过空间代谢组学对种子、胚胎、器官发育过程中空间代谢物分布的变化
④利用空间代谢组学对植物遗传品系进行判断和鉴定、以及筛选、评价优良品种
⑤通过空间代谢组学对特定的植物组织、器官深入研究植物营养成分及花果色泽的机制研究
1)高质量数据库:物质定性更准确
2)更丰富的技术实力和经验-具有针对不同样本类型的处理方面的经验
3)更成熟的数据分析和解读能力-具备优秀的生物信息学团队,能够提供全面的数据分析服务和准确的结果解读
4)更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队,能够及时跟进前沿文献,提供个性化的实验设计和方案
5)更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道,并能高效高质量的交付结果
总离子空间成像图
代表性单离子空间成像图
二维质谱成像聚类图
三维质谱成像聚类图
空间聚类分型图(手动分区)
差异代谢物空间成像图
多样本对比成像图示例
KEGG 代谢物分子网络图
CMeans 分析
表达模式功能分类重叠图
表达模式功能富集气泡图
Biofortified tomatoes provide a new route to vitamin D sufficiency. Nature plants, 17.352, 2023
采用根癌农杆菌介导的 CRISPR-Cas9 基因编技术敲除了 Sl7-DR2 酶,阻断 7-DHC 向胆固醇的转化,从而积累 7-DHC,实现番茄的稳定转化。之后,对于S17-DR2基因敲除品系进行筛选,通过空间代谢组学进行成像和质谱分析,最终发现,番茄叶片和绿色果实中胆固醇/SGA 生物合成、7-DHC 积累和光合作用关系密切。SI7-DR2突变体的叶子是维生素 D 3的丰富来源,因此可以提供一种重要的新原料,使用番茄种植产生的废弃植物材料从适合素食者的植物中制造维生素 D 3补充剂。
新鲜的固体成型组织
组织离体后迅速使用实验纸巾擦干样品表面血液或者其他体液
福尔马林浸泡、H&E染色和荧光标记后的组织不适用
切片面积需要小于玻片的面积,ITO导电玻片大小2.5cm*7.5cm
包埋剂可选用CMC(羧基甲纤维素)、明胶
避免使用OCT包埋,OCT在离子化时会抑制离子电流出现干扰峰,影响代谢物检出
联系电话:191 2100 2160
百沐生物孵化于复旦大学,核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成,专注于将人工智能(AI)技术与生物技术(BT)深度融合,为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台(BMBIOS)和小沐AI平台(AIGOBIO)。
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