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单细胞免疫组库

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产品介绍:

单细胞免疫组库测序(scVDJ-seq )是在单细胞水平同时检测转录组基因表达和TCR/BCR多样性,不但可以了解TCR/BCR克隆型,还可以联合转录组数据深入挖掘生命机理,为免疫组学研究提供更高效的平台。


技术原理:

应用方向:

免疫细胞亚群鉴定,免疫细胞状态分析,免疫应答与治疗研究,免疫耐受与免疫逃逸,免疫监测与诊断,疫苗研发,自身免疫性疾病研究


我们的优势:

1)更先进的平台选择-拥有高捕获效率的10X Genomics和国产单细胞捕获平台

2)更丰富的技术实力和经验-具有针对不同样本类型的单细胞悬液制备等样品处理方面的经验

3)更成熟的数据分析和解读能力-具备优秀的生物信息学团队,能够提供全面的数据分析服务和准确的结果解读

4)更灵活的定制化分析方案-具备专业的转化医学团队,能够及时跟进前沿文献,提供个性化的实验设计和方案

5)更优惠的价格和更短的交付周期-提供综合比价通道,并能高效高质量的交付结果




聚类分析



热图



注释细胞类型组织分布的点阵图



主要细胞类型组织分布的 UMAP 和条形图



RNA velocity 分析




热图



箱线图




拟时分析



差异表达基因的热图


Inhibitory CD161 receptor identified in glioma- infiltrating T cells by single-cell analysis , 2021, cell.


本研究首先利用单细胞免疫组库和单细胞转录组库技术,对异柠檬酸脱氢酶(IDH)野生型胶质母细胞瘤(IDH-G)和IDH突变型胶质瘤(GBM)患者的肿瘤浸润T细胞进行基因表达和克隆分布图谱的绘制。在T细胞亚群中发现了可能存在的抗肿瘤免疫效应。接着,对克隆扩增的肿瘤浸润性T细胞进行了详细分析,确定了候选抑制性受体,并通过敲除基因和抗体阻断等方法对其进行了通路验证。研究结果表明,CD161和其他自然杀伤细胞受体可以作为全新的免疫治疗靶点,可能为新型免疫治疗药物的开发和设计提供有力支持。





不同类型样品处理和准备:

(1)新鲜组织样品

新鲜组织从活体取下后,去除周围的脂肪、结缔组织或者坏死组织,用 4℃预冷的 PBS或者生理盐水冲洗干净,放在PBS或者组织保存液中冰上直接转移到解离实验室;一般要求组织量为黄豆大小(约 200mg);每个样品准备两个备份;组织太小,建议和实验室提前沟通,确定是否满足实验要求。新鲜组织也可通过组织保存液寄送到百沐生物实验室,具体操作参考实体组织组织保存液寄送要求。


(2)血液样品

取 5-10mL 新鲜血液迅速置于 EDTA 抗凝管中,4℃暂时保存和转移到实验室,也可以4℃寄送到实验室,寄送时间不超过 48h;小鼠等血液较少的可以准备1-2mL。


(3)体液

取 8-10mL 腹水、关节液和脑脊液等体液;冰上暂时保存和转移到实验室,立即进行单细胞悬液制备。


(4)冲洗液

肺泡灌洗液和膀胱冲洗液一般取 10-20mL 冰上暂时保存和转移到实验室,立即进行单细胞悬液制备。


(5)穿刺样品

穿刺样品量较少,需要多个穿刺样品(一般为 5 个)混合制备单细胞悬液,以保证足够的细胞量。


(6)细胞系

客户将培养的细胞收集后转交给百沐实验工程师;要求细胞总量为 50 万-100 万个/ 样品。


(7)单细胞悬液

分选后的细胞或客户制备好的单细胞悬液直接交给实验工程师,工程师进行细胞质检, 要求细胞总量一般至少为 10 万个


表 1 不同样品类型处理和准确总结:

样品类型

组织量

备份数

物种

保存条件

保存时间

切除新鲜

实体组织

200mg(黄豆大小)

2

人和小鼠

组织保存液,4℃

一般可以保存 48h ,最长 72h

其他

4℃转移到实验室,

组织保存液寄送提前沟通

 0-48h

穿刺样品

5 个混样

1

组织保存液,4℃

一般可以保存 48h ,最长 72h

新鲜血液

5mL-10mL

1

EDTA 抗凝管,4℃

一般可以保存 48 h

1-2mL

1

小鼠

EDTA 抗凝管,4℃

一般可以保存 48 h

体液

8-10mL

1

4℃转移到实验室

取样后尽快实验

冲洗液

10-20mL

1

4℃转移到实验室

取样后尽快实验

细胞系

50 万-100 万个

1

不限

4℃转移到实验室

取样后尽快实验


实体组织组织保存液寄送:

目前,人和小鼠的多种肿瘤组织和正常组织都可以通过组织保存液寄送,我们推荐使用美天旎组织保存液(货号:130-100-008),组织一般可以保存 48h,甚至 72h;客户可以自备组织保存液或者免费申请公司寄送。


(4)客户申请组织保存液:

合同确定后,客户至少提前 3 天通过销售申请组织保存液,申请时提供合同号,样本量、收件地址、联系人和电话;百沐生物实验室收到申请信息后将所需数量的保存液免费邮寄给客户(一般 17:00 前申请,当天邮寄;17:00 后申请第二天邮寄);邮寄的组织保存液一般为 2mL 离心管(内含 1.5mL 组织保存液),保存液的数量为 2 管/样品;通过冰袋邮寄给 客户。


(5)客户接收组织保存液:

客户收到组织保存液后,检查数量无误后可以立即使用或在4℃条件下保存。


(6)客户通过组织保存液寄送样品:

新鲜组织从活体取下后,去除周围的脂肪、结缔组织或者坏死组织,用预冷的 PBS 或者生理盐水冲洗干净;将组织分为黄豆大小(约 200mg)后放入组织保存液中,并轻轻颠倒离心管,使组织完全浸没到保存液中,补充一定量的保存液使其充满整个离心管;如果组织大于黄豆大小,建议分割成黄豆大小后放入不同的离心管中,组织太多,影响组织的保存效果。在离心管管盖和管壁同时标注样品名称,且管壁标注组织类型、浸入保存液时间;然后用封口膜封好,防止运输过程中离心管开盖;一般一个样品准备两个备份;将封好的离心管装入自封袋中,标注合同编号和客户姓名;将自封袋用棉花或者纱布包裹,避免离心管和冰袋直接接触,防止样品冷冻。用冰袋寄送样品(夏天放 10-15 个冰袋;冬天禁止使用-80℃立即拿出的冰袋,防止样品冻结),保证 48h 内到达百沐生物实验室,个别样品可以保存 72h。


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百沐生物孵化于复旦大学,核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成,专注于将人工智能(AI)技术与生物技术(BT)深度融合,为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台(BMBIOS)和小沐AI平台(AIGOBIO)。

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