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真核转录组测序

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产品介绍:

真核转录组测序是一种高通量测序技术,用于研究真核生物基因组内所有转录的RNA分子。在真核生物中,DNA通过转录过程产生mRNA、rRNA和tRNA等不同类型的RNA分子,这些RNA分子包含了真核生物基因组的表达信息。通过真核转录组测序,可以同时测定和鉴定出这些RNA分子的序列和数量,从而揭示基因表达的整体图景。


技术原理:

真核转录组测序基于高通量测序,可快速获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的所有转录本的集合,用于研究基因结构和基因功能、可变剪接和新转录本预测等。


分析流程:

应用方向:

1)基因表达调控研究: 真核转录组测序可以揭示不同细胞类型、生理状态或疾病状态下基因的表达变化,从而帮助了解基因表达调控的机制。

2)发育生物学研究: 通过比较不同发育阶段的转录组数据,可以了解基因在生物体发育过程中的表达模式变化,以及这些模式与器官发育和分化之间的关系。

3)疾病机制研究: 真核转录组测序可以揭示疾病状态下基因表达的变化,帮助找到与疾病相关的生物学过程和潜在的治疗靶点。

4)药物治疗研究: 通过转录组测序可以评估药物对基因表达的影响,帮助了解药物的作用机制、疗效和不良反应。

5)代谢途径分析: 通过分析转录组数据,可以了解基因在代谢途径中的参与程度,帮助研究代谢调控和代谢疾病。

6)功能基因组学研究: 真核转录组测序有助于识别编码蛋白质的基因以及非编码RNA,以及揭示其在生物学过程中的功能。

7)细胞信号传导和通路分析: 通过分析转录组数据,可以了解不同信号通路和调控网络在特定条件下的活性和互动。

8)非编码RNA研究: 真核转录组测序有助于发现和研究非编码RNA,如长链非编码RNA(lncRNA)和微小RNA(miRNA),以及它们在基因调控中的作用。

9)生态学和环境研究: 真核转录组测序可以用于研究生态系统中不同生物的基因表达响应,揭示环境变化对生物的影响。


我们的优势:

1)高质量的数据生成

2)完备的覆盖范围

3)多维度的数据分析

4)专业的数据解读

5)报告以及定制化的服务



GC含量分布



Veen图




GO注释




KEGG代谢通路分类统计





样本基因表达TPM密度分布图




不同实验条件下TPM厢式图




差异基因火山图




差异基因聚类热图




KEGG富集分析通路图


MOTS-c and exercise restore cardiac function by activating of NRG1-ErbB signaling in diabetic rats(Frontiers in Endocrinology,5.555)


MOTS-c和有氧运动通过激活NRG1-ErbB信号通路恢复糖尿病大鼠心脏功能


有氧运动和MOTS-c治疗均可显著减少糖尿病心脏结构和功能的异常;有氧运动和MOTS-c所改变的两组糖尿病致病基因其功能均富集于炎症、心肌细胞凋亡、血管生成和内皮细胞增殖三方面,其中NRG1-ErbB4通路可能是MOTS-c在恢复糖尿病心脏功能障碍方面的运动模拟效应的关键。本文的研究可能有助于更好地理解MOTS-c和有氧运动对糖尿病心脏舒张功能障碍的影响,并为MOTS-c改善糖尿病心脏舒张功能障碍的运动模拟分子机制打开了新的思路。



转录组数据差异基因分析结果



差异基因的功能富集分析


样本量要求:

细胞样品>1×106个·动物组织:肝脏、心脏、脑等动物组织>0.2g;个体较大动物如猪、牛、羊的肌肉组织>0.5g;脂肪组织>1g;肿瘤组织 > 0.2g。


植物组织:

花序、花蕊、花粉>0.2g;叶片、株系>0.5g;根系、茎秆>1g;果实、种子>3g;微生物1×106 个或 ≥300mg;RNA样品需求量:RNA≥10 μg


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