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多组学文献分享
多组学百问系列
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Q:单细胞转录组(scRNA-seq)和单细胞核转录组(snRNA-seq)测序有什么差别?A:核心:适用场景不一样,原则上优先推荐单细胞转录组,如果样本是冷冻或者大粒径细胞(直径>60μm),那就建...
Q:细胞数太少了怎么做单细胞测序?A:单细胞测序对于细胞活性和细胞起始量要求都比较高,一般细胞数量要满足10^5个。若细胞数量太少,有三种方法进行改善:若组织块太小,老师可以考虑多个样本混样制备单细胞...
Q:没有明确的marker基因,如何开展单细胞研究?A:没有marker基因也可以进行单细胞测序。marker基因目的是为了细胞降维分群后进行细胞注释鉴定细胞类型。实际上细胞注释一方面依赖于数据库进行...
Q:Marker基因是什么呢?如何找到Marker 基因?A:某类基因在目的细胞群体中特异性表达且表达量高,而其它细胞群体中表达量低或者几乎不表达,我们一般把这类基因胞称为Marker 基因。一般通过...
Q:做平行实验时,发现同一个来源的样本,降维聚类分群结果差异很大,如何避免?A:即使是相同的样本做重复性实验,得到的单细胞的数据也不会直接重复度很高,所以在进行数据分析的时候,需要对提取出来的表达量数...
Q:解离得到的单细胞悬液,发现除了细胞活性<85%以外,其他指标都符合标准,可以上机实验吗?A:若发现细胞活性接近85%(比如细胞活性~80%),建议客户可以风险上机。若细胞活性很低(比如~60%甚至...
Q:如何计算细胞数量,以及鉴定细胞活性?A:可以通过台盼蓝对单细胞悬液进行染色,然后加入到细胞计数板中,并在显微镜下观察细胞活性并进行计数;也可以通过AO/PI双荧光染色法进行计数,这种方法更精准更省...
Q:制备单细胞悬液时,不同的组织要选择什么类型的解离酶比较合适呢?A:制备单细胞悬液,需要根据组织类型选择不同的酶进行解离,甚至可以选择多种酶的混合。下表展示酶的种类及适用组织类型,一般老师如果没有丰...
Q:都是单细胞测序,10X单细胞测序和smart-seq有什么区别?A:smart-seq是一个细胞建一个文库,因此价格是按照细胞数目进行计算的,这决定了当细胞通量达到较大数值时,项目预算会非常巨大。...
Q:10X单细胞测序可以研究什么RNA?A:10X单细胞测序利用polyT标记polyA,因此含有polyA的mRNA可以通过10X单细胞测序方法进行研究,包括真核生物的mRNA,部分lncRNA,以...
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百沐生物孵化于复旦大学,核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成,专注于将人工智能(AI)技术与生物技术(BT)深度融合,为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台(BMBIOS)和小沐AI平台(AIGOBIO)。
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