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小沐同学（AI）|单细胞测序100问(28)

2023-11-13

来源：上海百沐生物科技有限公司

所属分类：单细胞测序100问

Q：没有明确的marker基因，如何开展单细胞研究？

A：

没有marker基因也可以进行单细胞测序。marker基因目的是为了细胞降维分群后进行细胞注释鉴定细胞类型。实际上细胞注释一方面依赖于数据库进行自动化注释，但是自动化注释存在一定的局限，后期需要进行人工校正。如果没有相应组织类型marker基因可以通过搜集文献整理同源物种marker基因进行手动注释或者直接根据测序数据鉴定的marker基因或者差异基因富集来命名细胞类型，比如发表在NC上研究鸡心脏发育时空图谱，就是利用测序检测到的细胞特征性表达基因鉴定marker基因结合参考文献的方式对细胞进行注释，所以没有研究过的物种或者没有明确marker基因一样都是有迹可循进行细胞鉴定分析。


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