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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(22)

2023-11-13

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:都是单细胞测序,10X单细胞测序和smart-seq有什么区别?

A:

smart-seq是一个细胞建一个文库,因此价格是按照细胞数目进行计算的,这决定了当细胞通量达到较大数值时,项目预算会非常巨大。10X是一个样本一个文库,单个样本的细胞数目是几千到一万,因此价格核算到细胞水平,每个细胞的价格在几元。因此10X单细胞测序更有利于高通量的单细胞转录组研究。Smart-seq是一个全长转录组的测序,10X单细胞只针对3’端或5’端的150bp的测序,因此,如果想要关注全转录本的序列,smart-seq是更好的选择。10X仅适用于直径在40um以下的细胞,因此,若想要研究直径较大的细胞,可选择smat-seq或者10X的单细胞核测序。


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