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2023-11-13
来源：上海百沐生物科技有限公司
所属分类：单细胞测序100问
Q：10X单细胞测序可以研究什么RNA？
A：
10X单细胞测序利用polyT标记polyA，因此含有polyA的mRNA可以通过10X单细胞测序方法进行研究，包括真核生物的mRNA，部分lncRNA，以及有polyA的部分病毒的RNA。不含有polyA的RNA，如miRNA，circRNA、原核生物的mRNA以及核糖体RNA，则不能用现有的方法进行分析。除mRNA以外的研究，可参考以下文章：
LncRNA的单细胞水平研究：
[1] Shaath H , Vishnubalaji R , Elango R , et al. Single-cell long noncoding RNA (lncRNA) transcriptome implicates MALAT1 in triple-negative breast cancer (TNBC) resistance to neoadjuvant chemotherapy[J]. Cell Death Discovery, 2021, 7(1):23.
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