小沐同学（AI）|单细胞测序100问(21)

Q：10X单细胞测序可以研究什么RNA？

A：

10X单细胞测序利用polyT标记polyA，因此含有polyA的mRNA可以通过10X单细胞测序方法进行研究，包括真核生物的mRNA，部分lncRNA，以及有polyA的部分病毒的RNA。不含有polyA的RNA，如miRNA，circRNA、原核生物的mRNA以及核糖体RNA，则不能用现有的方法进行分析。除mRNA以外的研究，可参考以下文章：

LncRNA的单细胞水平研究：

[1] Shaath H , Vishnubalaji R , Elango R , et al. Single-cell long noncoding RNA (lncRNA) transcriptome implicates MALAT1 in triple-negative breast cancer (TNBC) resistance to neoadjuvant chemotherapy[J]. Cell Death Discovery, 2021, 7(1):23.