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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(29)

2023-11-13

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:细胞数太少了怎么做单细胞测序?

A:

单细胞测序对于细胞活性和细胞起始量要求都比较高,一般细胞数量要满足10^5个。若细胞数量太少,有三种方法进行改善:

  • 若组织块太小,老师可以考虑多个样本混样制备单细胞悬液,保证解离足够多的细胞数;


  • 也可以通过多个样本流式富集足够的细胞数进行单细胞测序;

  • 若某类细胞比例偏低,解离得到细胞数较少,建议直接解离整个组织,提高目标细胞捕获数1万以上,只要目标细胞群占比丰度在1%以上就可以检测到。后续可以通过调取目标细胞群数据进行针对性亚群分群和差异分析,同样可以进行目标群研究。


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