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小沐同学(AI)|免疫组库100问(9)-原理篇

2024-02-28

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:免疫组库100问

Q:免疫组测序,使用 RNA 还是gDNA,如何选择?

A:

关于如何选择 RNA 还是 DNA,以及建库方法,这重点取决于样本情况和相关研究目的。

(1) 一般建议首选建议使用 RNA,原因如下:

  1. 基于 mRNA 的免疫组克隆种类更多。

  2. 基于 RNA 免疫组受体测序均是功能性蛋白序列,与抗原诱导和疾病特异性相关较高。

  3. 基于 mRNA 的免疫组测序能区分 C区Ig 亚型信息

  4. 基于 mRNA 的免疫组扩增,可获得 VDJ 全长信息。

  5. 基于 RNA 层面开展的免疫组临床诊断和治疗转化应用更多。

(2) 以下情况适用建议选择 DNA 作为模版

  1. 相对定量淋巴 T/B 细胞数量。

  2. 仅能提取 DNA 的样本,如 FFPE 等,样本要求相对较低


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