2024-02-28
来源:上海百沐生物科技有限公司
所属分类:免疫组库100问
关于如何选择 RNA 还是 DNA,以及建库方法,这重点取决于样本情况和相关研究目的。
(1) 一般建议首选建议使用 RNA,原因如下:
基于 mRNA 的免疫组克隆种类更多。
基于 RNA 免疫组受体测序均是功能性蛋白序列,与抗原诱导和疾病特异性相关较高。
基于 mRNA 的免疫组测序能区分 C区Ig 亚型信息
基于 mRNA 的免疫组扩增,可获得 VDJ 全长信息。
基于 RNA 层面开展的免疫组临床诊断和治疗转化应用更多。
(2) 以下情况适用建议选择 DNA 作为模版
相对定量淋巴 T/B 细胞数量。
仅能提取 DNA 的样本,如 FFPE 等,样本要求相对较低
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