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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(65)-分析篇

2023-11-15

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:单细胞分析中,如何鉴定细胞类型?

A:

对于单细胞而言, 批次效应主要有以下主要的影响因素:

  1. 不同样本

  2. 同一样本的生物学重复

  3. 同一样本的技术重复

  4. 同一样本在同一个实验室由同一团队在不同时间点处理

  5. 不同测序平台, BGI或Illumina

目前,单细胞建库和测序平台大多数情况下是一致的,因此最为关注的批次因素是来自不同样本或实验室之间数据。如果批次效应比较小还可以接受,如果批次效应很严重, 就可能会和真实的生物学差异相混淆, 让结果难以捉摸。




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