2023-11-15
来源:上海百沐生物科技有限公司
所属分类:单细胞测序100问
对于单细胞而言, 批次效应主要有以下主要的影响因素:
不同样本
同一样本的生物学重复
同一样本的技术重复
同一样本在同一个实验室由同一团队在不同时间点处理
不同测序平台, BGI或Illumina
目前,单细胞建库和测序平台大多数情况下是一致的,因此最为关注的批次因素是来自不同样本或实验室之间数据。如果批次效应比较小还可以接受,如果批次效应很严重, 就可能会和真实的生物学差异相混淆, 让结果难以捉摸。
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