小沐同学（AI）|单细胞测序100问(64)-分析篇

Q：单细胞分析中，如何鉴定细胞类型？

A：

在生物学上，不同的细胞具有不同的表型，细胞的表面抗原，或者特定的表达基因会有所区别，这些基因称为marker基因，可以通过对每个细胞内marker基因的识别，来鉴定该细胞的类型。例如在B细胞中，可以根据细胞是否表达浆细胞表面抗原，来识别B细胞中的浆细胞。此外，在发育的谱系中，例如内胚层细胞，其也有着与外胚层细胞不同的marker基因。

不过，通过marker基因对细胞类型进行分配有一定的局限性，我们知道B细胞会高表达B细胞表面抗原MS4A1，但是我们所测得的B细胞却有着不同的状态，如幼稚B细胞，成熟B细胞，浆细胞等，甚至还有一些疾病/组织特异性B细胞。故细胞类型的注释并不是绝对的，我们一般会首先获得大类细胞，再从大类细胞中识别细胞类型的"亚型"或"细胞状态"。