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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(64)-分析篇

2023-11-15

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:单细胞分析中,如何鉴定细胞类型?

A:

在生物学上,不同的细胞具有不同的表型,细胞的表面抗原,或者特定的表达基因会有所区别,这些基因称为marker基因,可以通过对每个细胞内marker基因的识别,来鉴定该细胞的类型。例如在B细胞中,可以根据细胞是否表达浆细胞表面抗原,来识别B细胞中的浆细胞。此外,在发育的谱系中,例如内胚层细胞,其也有着与外胚层细胞不同的marker基因。

不过,通过marker基因对细胞类型进行分配有一定的局限性,我们知道B细胞会高表达B细胞表面抗原MS4A1,但是我们所测得的B细胞却有着不同的状态,如幼稚B细胞,成熟B细胞,浆细胞等,甚至还有一些疾病/组织特异性B细胞。故细胞类型的注释并不是绝对的,我们一般会首先获得大类细胞,再从大类细胞中识别细胞类型的"亚型"或"细胞状态"。


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