文献阅读分享｜单细胞转录组和空间转录组技术的联合应用

单细胞转录组和空间转录组是两种用于研究细胞内基因表达的重要技术。单细胞转录组能够揭示单个细胞内的基因表达谱，而空间转录组则可以在组织层面上提供基因表达的空间分布信息。联合应用这两种技术可以更全面地理解基因表达在细胞和组织水平上的动态变化。

首先，单细胞转录组技术能够在单个细胞水平上揭示基因表达的差异。通过对单细胞的RNA进行测序，可以获得每个细胞内数千个基因的表达量信息，从而揭示出细胞类型的多样性和功能的多样性。这种技术可以帮助研究人员更好地了解细胞在生理和病理状态下的表达模式。

其次，空间转录组技术能够提供基因表达的空间分布信息。通过这种技术，可以在组织层面上揭示基因表达的空间分布，从而揭示出不同细胞类型在组织内的分布情况，以及不同细胞之间的交流和相互作用。

当单细胞转录组和空间转录组联合应用时，可以更全面地理解基因表达在细胞和组织水平上的动态变化。例如，可以通过单细胞转录组技术了解不同细胞类型的表达模式，然后通过空间转录组技术在组织层面上验证这些表达模式的空间分布情况，从而更全面地了解细胞和组织内基因表达的调控机制。

来自参考文献1

来自参考文献2

参考文献：

1. Longo SK, Guo MG, Ji AL,Khavari PA. Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidateintercellular tissue dynamics. Nat Rev Genet. 2021; 22(10): 627-644.

2. Fawkner-Corbett D,Antanaviciute A, Parikh K, et al. Spatiotemporal analysis of human intestinaldevelopment at single-cell resolution. Cell. 2021; 184(3): 810-826.