小沐同学（AI）|单细胞测序100问(78)-分析篇

Q：如何筛选高变基因？

A：

Answer: 高变基因是指在不同细胞中表达量具有显著差异的基因。高变基因在不同细胞之间的表达差异可以对识别细胞的特性提供重要信息。筛选高变基因，一方面把能够反映细胞间差异的重要信息筛选出来，另一方面能够降低数据的维度以便于下游分析。通常可以采用基因表达水平的变异系数 (coefficient of variation)来判断高变基因。每一个基因的变异系数定义为该基因在不同细胞中表达水平的标准差与均值的比。以基因 i 为例，设 yi 是由基因 i 在各个细胞中表达值(已经过预处理后的)构成的 m 维向量，则基因 i 的变异系数 cvi 为

其中 sd(yi)表示向量yi各个分量的标准差，mena(yi)表示向量yi各个分量的均值。对每一个基因计算出变异系数后，将变异系数从大到小排列，筛选变异系数大的基因作为高变基因进行下游分析。