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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(77)-分析篇

2023-11-20

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:常见doublet细胞过滤方法有哪些?

A:

Answer: 为了解决测序过程中出现的doublet问题,大量doublet细胞过滤方法被开发,包括Scrublet、doubletCells、cxds、bcds、Hybrid、DoubletDetection、DoubletFinder、DoubletDecon等方法,参考相关文献[1],认为DoubletFinder方法的doublet识别准确率最高


[1] Xi N M, Li J J. Benchmarking computational doublet-detection methods for single-cell RNA sequencing data[J]. Cell systems, 2021, 12(2): 176-194. e6.





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