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2023-11-20
来源：上海百沐生物科技有限公司
所属分类：单细胞测序100问
A：
关注case组存在的特殊类群细胞；
关注case组和control组的特定细胞类群的数目；
关注case和control组差异表达基因。
比如检测到肿瘤病人组织特有的细胞类群TSK，分析这群细胞在组织上的分布，确定这些细胞在肿瘤扩展中的意义。如果发现在case组中的细胞类群的细胞数目存在差异，可进而关注到这两类细胞，将这两类细胞进行重新分群，发现case组的subcluster0和1的细胞数目存在差异；进而关注到这两个亚群的细胞，分析这两个亚群的marker基因。
分析case和control的差异表达基因，比较不同细胞类型在组间的差异基因，并挑选表达上调和下调的基因，做拟时序分析，针对某一个geneset，分析geneset在组间的差异。分析组间差异的转录因子和下游基因，以及组间差异基因的GO分析。
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百沐生物孵化于复旦大学，核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成，专注于将人工智能（AI）技术与生物技术（BT）深度融合，为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台（BMBIOS）和小沐AI平台（AIGOBIO）。
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