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2023-11-20
来源：上海百沐生物科技有限公司
所属分类：单细胞测序100问
A：计数归一化，对于准确比较细胞（或样本）之间的基因表达至关重要。理想情况下，每个基因的映射读数计数与RNA的表达成正比。由于单细胞测序技术的限制，我们在样本中获得RNA的时候，经过了分子捕获，逆转录还有测序。这些步骤会影响同一种细胞的细胞间的测序计数深度的变异性，故单细胞测序数据中的细胞间差异可能会包含了这部分测序误差，等价于计数矩阵中包含了变化很大的方差项。但在目前的统计方法中，绝大部分模型都预先假定了数据具有相同的方差结构。归一化是缩放原始计数值的过程。以这种方式，细胞之间或细胞内的表达水平更具可比性。
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