文献阅读分享｜幼年特发性关节炎的单细胞RNA测序

幼年特发性关节炎(JIA)是儿童最常见的慢性炎症性风湿性疾病之一，发病年龄在16岁以前，持续时间超过6周。对于一些JIA患者，早期发现和干预仍然具有挑战性。因此，需要对JIA的复杂和未知的机制进行进一步的研究。

传统的转录组测序测量大细胞群中单个基因的平均表达，并可用于研究组织间的差异表达。然而，它不足以分析更多样的细胞系统，并且许多低丰度信息在整体表征中丢失。单细胞RNA测序(scRNA-seq)已经发展成为高通量转录组测序的有利技术。它可以在单个细胞水平上呈现表达谱，使我们能够更有效地解决细胞间的异质性，识别新的和罕见的细胞类型，并深入了解细胞生长过程中表达机制的调节。利用scRNA-seq研究JIA可以揭示疾病的异质性，为阐明特定细胞类型的功能提供新思路，并指导治疗方法。

图1. 单细胞转录组测序流程图。

图2. sJIA患者单核细胞或巨噬细胞的鉴定及sJIA小鼠模型的建立

图3. 在单细胞水平上描述SF中的T细胞亚群。

本文总结了单细胞分析在区分细胞亚群和贾发病机制中的潜在生物标志物的应用。多水平的信息支持JIA的异质性，并建议需要对患者进行更多的分层。单细胞数据的更深入挖掘可能有助于患者区分和精确诊断。它甚至可以与治疗相结合，以促进临床护理和耐药性识别策略。然而，由于JIA患者在疾病进展的早期由于严重的临床症状而接受药物治疗，因此难以获得治疗前疾病的病理背景和治疗后的免疫改变，并且可能存在不可避免的有效细胞的破坏或损失、低覆盖率和有偏倚的测序结果。因此，优化单细胞测序结合蛋白基因组学或其他研究策略来识别细胞亚群信号通路将有利于今后对生物标志物的多维筛选和验证，以及对JIA及其并发症的准确分型和早期预后。

参考文献：Luo X, Tang X. Single-cell RNA sequencing in juvenile idiopathic arthritis. Genes Dis. 2023 May 24;11(2):633-644. doi: 10.1016/j.gendis.2023.04.014. PMID: 37692495; PMCID: PMC10491939.