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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(35)

2023-11-13

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:制备单细胞悬液的时候,如果出现结团现象该如何解决?

A:

首先应该先判定下出现结团现象的可能的原因,一般原因可能有以下几种情况,可以根据原因来进行针对性优化:

  • 组织特性,例如血管或皮肤等样本本身容易出现细胞结团现象,可判定细胞总数和结团率,如数量足够,结团率在20%以下,可经细胞筛过滤后再进行后续处理。

  • 酶解不完全,导致细胞间连接尚未分离或者;可再重新优化酶解的温度和时间等条件。

  • 离心过程中速度太大或细胞悬液静置时间较长,导致的自然结团;可用无钙镁平衡盐溶液重新洗涤细胞,也可以加入适用的EDTA,但注意浓度不可超过2mM。

  • 酶解过程中细胞损伤,导致DNA释放到悬液中,可能会附着到未消化的组织,影响蛋白酶的进一步消化导致结团或者附着到细胞上导致聚集成团;可少量添加DnaseⅠ,浓度不宜超过0.1 mg/mL,注意轻柔吹打细胞,从而可以消化游离DNA而不损伤完整细胞。


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