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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(32)

2023-11-13

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:测序饱和度达到多少,不需要进行后续加测了?

A:

测序饱和度是反映当前测序量与文库复杂度相关性的指标,其大小主要取决于测序深度和文库复杂度(细胞质量、细胞异质性、细胞数目、RNA含量等)。这个指标非常重要,如果捕获的细胞数较多,但是每个细胞里面的平均reads数少,那么饱和度就较低;反之饱和度较高。测序数据量为100G时,对于人鼠样本,测序饱和度≥50%即可。


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