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小沐同学（AI）|单细胞测序100问(19)

2023-11-06

来源：上海百沐生物科技有限公司

所属分类：单细胞测序100问

Q：单细胞转录组测序使用何种方法对mRNA进行扩增？原理是什么？ 

A：

单细胞转录组使用基于Smart-seq 的单细胞扩增技术，其原理是在合成 cDNA 的反应中事先加入的 3'末端带 Oligo(dG)的 SMART 引物，由于逆转录酶以 mRNA 为模板合成 cDNA，在到达 mRNA 的 5'末端时碰到真核 mRNA 特有的“帽子结构”，即甲基化的 G 时会连续在合成的 cDNA 末端加上几个 dC， SMART 引物的Oligo(dG)与合成 cDNA 末端突出的几个 C 配对后形成 cDNA 的延伸模板，逆转录酶会自动转换模板，以 SMART 引物作为延伸模板继续延伸 cDNA 单链直到引物的末端，这样得到的所有 cDNA 单链的一端有含 Oligo(dT)的起始引物序列，另一端有已知的 SMART 引物序列，合成第二链后可以利用通用引物进行扩增。由于有 5'帽子结构的 mRNA 才能利用这个反应得到能扩增的 cDNA，因此扩增得到的 cDNA 就是全长 cDNA。


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百沐生物孵化于复旦大学，核心团队由复旦大学、中科院、协和医院等知名科研院所的卓越科学家以及来自阿里、美团、小米、生物医药集团等头部互联网科技公司和大型药企集团的综合背景精英组成，专注于将人工智能（AI）技术与生物技术（BT）深度融合，为生命科学研究和精准医疗领域带来创新解决方案。 公司核心平台为自研单细胞平台（BMBIOS）和小沐AI平台（AIGOBIO）。

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