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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(15)

2023-11-03

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

Q:如何处理样本中的死细胞和其他干扰物质,以减少背景噪声?

A:

解离后的单细胞粗液内仍含有不同含量的细胞团、组织碎片、红细胞和凋亡细胞,将对单细胞测序建库造成影响:细胞团块无法被成功捕获和包裹、组织碎片和凋亡细胞黏附核酸影响细胞回收率、红细胞大量存在降低了测序有效性且提高了测序成本。可使用红细胞裂解液去除含血细胞较多的组织块解离后的红细胞、碎片去除溶液去除组织解离后的碎片、死细胞去除试剂盒识别已经死亡和凋亡的细胞并充分去除,获得高活性的单细胞悬液,满足单细胞测序建库标准的同时,节约测序成本,确保测序结果有效性。

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