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小沐同学(AI)|单细胞测序100问(10)

2023-11-02

来源:上海百沐生物科技有限公司

所属分类:单细胞测序100问

问: 单细胞测序的常见技术有哪些?

答:常见的单细胞多组学测序服务包括以下几种:

  • 单细胞转录组测序(Single-cell RNA sequencing,scRNA-seq):通过测量单个细胞中的转录本表达水平,揭示细胞类型、细胞状态和细胞间的转录调控关系。

  • 单细胞ATAC测序(Single-cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin sequencing,scATAC-seq):通过测量单个细胞中的染色质开放区域,揭示细胞类型、细胞状态和基因调控元件的使用情况。

  • 单细胞CHIP测序(Single-cell Chromatin Immunoprecipitation sequencing,scChIP-seq):通过测量单个细胞中的染色质上特定蛋白质的结合情况,揭示细胞类型、细胞状态和基因调控网络。

  • 单细胞免疫组测序(Single-cell Immune Repertoire sequencing,scTCR-seq和scBCR-seq):通过测量单个免疫细胞中的T细胞受体(TCR)或B细胞受体(BCR)的重排序列,揭示免疫细胞的多样性和克隆性。

  • 单细胞蛋白组测序(Single-cell Proteomics sequencing,scProteomics-seq):通过测量单个细胞中的蛋白质表达水平,揭示细胞类型、细胞状态和蛋白质相互作用网络。

  • 微生物单细胞测序(Single-cell Microbiome sequencing):通过测量微生物群落中的单个细菌细胞的基因组序列,揭示微生物群落的多样性和功能。

  • 单细胞全基因组测序(Single-cell Whole Genome sequencing,scWGS)通过测量单个细胞的全基因组序列,揭示细胞间的遗传变异和基因组结构。

这些单细胞多组学测序服务可以提供全面的细胞分析,帮助研究人员深入了解细胞的多样性、功能和相互作用。不同的测序服务可以根据研究需求进行选择和组合,以获得更全面的单细胞信息。


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